SutterPatch® 软件是一款功能齐全的电生理数据采集、管理和分析应用程序,适用于 Windows 或 Mac OS 计算机,由我们传奇的免费技术支持提供支持。SutterPatch 与所有 Sutter Instrument 膜片钳放大器系统捆绑在一起。该软件控制数据采集,提供实时测量以帮助在实验期间做出决策,跟踪所有放大器参数,记录实验进度并存储多达 600 个元数据参数。SutterPatch 内置于 WaveMetrics, Inc. 最新版本的 Igor Pro 中,可立即访问 Igor 强大的科学和工程分析工具。SutterPatch 每天都在积极扩展和开发,目标是成为全球电生理学的标准。
SutterPatch 软件第 2 版增加了对新 dPatch® 数字补丁放大器系统的支持,以及许多新功能和用户界面改进,这些也适用于 IPA 系列放大器系统。膜测试和自由运行已升级。新的三重滑块和 2D 矩阵控件有助于在放大器控制面板中进行补偿调整。
特别强调通过大型数据集进行直观导航。从电生理学软件或其他领域的应用程序中熟悉的控件,以及全新的方法,使得找到实验的特定部分变得非常容易。
数据文件的结构化架构旨在保留实验中每个样本的上下文。在实验开始时不费吹灰之力,就可以记录大量元数据参数——在可能的情况下自动记录,由用户在需要的地方进行配置。在执行范例或例程之前,可以查看每个参数。
SutterPatch 软件附带了一组示例范式和例程,有助于配置常用的实验场景。
SutterPatch 提供实时分析功能,可在实验进行时自动创建图形,如 IV 曲线或时间进程图。最多可以显示 8 个分析图,每个分析图来自输入信号的 16 个可能的测量值。分析包括平均值、斜率、上升时间、阈值交叉频率等。这有助于对进一步的实验过程做出决定。
除了实时分析之外,SutterPatch 还支持在实验后对最复杂的分析程序进行进一步处理。SutterPatch 在 Igor Pro 原生的扩展分析功能集之上添加了特定于应用程序的功能。方程和变量有助于在例程和范式中使用更复杂的算法。
SUTTERPatch 功能
支持所有 Sutter 仪器放大器系统,包括新的 dPatch® 数字膜片钳记录系统
Scope Window 提供直观、高效的数据导航
膜测试跟踪细胞健康和其他质量控制参数
使用或不使用命令波形的例程控制数据采集
具有用于许多常见应用程序的预配置范例的示例例程池
来自 Sutter Instrument 硬件的硬接线信号和辅助输入信号被记录下来
施加到电池的命令信号被监控和记录
模拟和数字输出信号控制外围和第三方信息
每次扫描多达 50 个分段,在塑造最复杂的命令波形时具有最大的灵活性
预配置的段形状,如正弦波、方波和啁啾,便于波形设计
波形模板可以将记录的信号“回放”到单元格或将数学表达式应用为波形
测量为实时分析提供基础,并在实验过程中做出决策
范式可实现流程自动化并消除操作员偏见
解决方案编辑器可让您跟踪解决方案和化合物,并支持对解决方案切换器的直接控制
初始条件和所有解决方案更改都会自动写入元数据
模拟或数字输出控制所有常见的解决方案切换器
数据导航器以树状结构显示整个实验
第一个采集信号的预览
快速访问范式审查、再分析范围、元数据和常规信息
实时和离线分析,包括微型/突触事件检测和动作电位表征
支持 IPA 多放大器模式
可以连接任意两个 IPA® 或双 IPA® 放大器的组合
最多支持 16 个输入通道
新的!Sutter Instrument 推出:
动态钳位 - SutterPatch® 软件和 dPatch® 数字膜片钳放大器的新功能
动态钳技术于 1993 年首次引入,作为一种在膜片钳记录期间模拟神经元中离子电导的方法。这种方法通常包括记录细胞的膜电位,将数据传输到计算机,计算注入神经元的适当电流,并将该值发送回放大器。计算机和放大器之间的通信限制了动态钳位计算的更新速率。此外,进行动态钳位所需的额外硬件和软件限制了其应用。现在可以免费升级 SutterPatch 软件和 dPatch 放大器,为有兴趣进行动态钳位实验的研究人员提供一体化解决方案。
dPatch 放大器系统的专利数字架构为动态钳位提供了理想平台。dPatch 由片上系统提供支持,该片上系统提供跨现场可编程门阵列 (FPGA) 和两个高速 ARM 核心处理器的并行处理。在这个架构中实现了几个复杂的动态钳位模型。在每个模型中,应用电流值的更新都发生在 dPatch 和计算机之间没有通信的情况下。根据模型的复杂性,可以实现高达 500 kHz 的更新速率。
模拟神经元膜内的一组通道涉及模拟通道门控机制的动力学。这些通道动力学可以使用霍奇金-赫胥黎模型中的多个独立门进行建模,也可以使用多状态马尔可夫模型进行建模。对于 Hodgkin-Huxley 风格的模型,dPatch 为每个模拟通道提供多达 16 个单独的门,每个探头最多同时运行八个模拟通道。对于马尔可夫模型,最多可以同时运行四个 14 状态模型,或者可以运行八个状态较少的模型。例如,八个 10 状态模型可以同时运行。
然后使用从门控方程导出的值来计算施加到神经元的电流。电流的计算可以用电导或磁导率来定义。对于电导模型,门控计算定义的值与通过模拟通道的离子的反转电位以及模拟通道的电导相结合。此外,通道电导值可能与电压有关。对于渗透率模型,门控计算定义的值与通过模拟通道的离子的细胞内和细胞外浓度相结合。这些模型模拟了 Goldman-Hodgkin-Katz 方程。
SutterPatch 软件是一款直观、功能齐全的数据采集、管理和分析应用程序,旨在在 Windows 或 Mac OS 计算机上运行。SutterPatch 与 dPatch 放大器捆绑在一起。动态钳位用户界面为加载动态钳位模型提供了强大的机制。不需要脚本方面的专业知识。门方程或马尔可夫模型转换只需作为文本输入并由 SutterPatch 解释。单独的动态钳模型保存在一个池中,并且可以在用户之间轻松传输。此外,还提供了许多示例模型来帮助用户入门,从简单的漏电导到 12 态钠通道。
概括
SutterPatch 软件和 dPatch 放大器的免费升级为有兴趣进行动态钳位实验的研究人员提供了第一个一体化解决方案。
快速动态钳位更新率源于 dPatch 放大器的专利数字架构。
支持的型号包括:
霍奇金-赫胥黎风格的电导模型
Goldman-Hodgkin-Katz 风格的渗透模型
马尔可夫模型
SutterPatch 软件控制动态钳位不需要脚本。